La Auditoría Superior de la Federación indicó que, en 2020 Pemex cumplió en las actividades de planeación, coordinación, gestión de riesgos y supervisión de los avances del proyecto de construcción de la Refinería de Dos Bocas.

Al 31 de diciembre de 2020, Pemex reportó un avance del 19.5% en el desarrollo de los trabajos del proyecto y del 16.5% en los recursos erogados, lo que representó un cumplimiento del 90.3% y del 76.4%, respectivamente, en relación con las metas previstas.
Mientras tanto, al 31 de diciembre de 2021, Pemex registró un avance del 72.4% en el desarrollo de los trabajos del proyecto, porcentaje con el que se cumplió y superó la meta de avance prevista para ese año del 52.4%.